iPhone 16E mengusung layar Super Retina XDR 6,1 inci dengan teknologi OLED yang memberikan tampilan tajam dan jernih. Berbeda dengan iPhone 16 yang memiliki Dynamic Island, model ini justru kembali menggunakan notch seperti pada iPhone 14 untuk menampung kamera selfie dan Face ID.

Meskipun tidak memiliki fitur interaktif Dynamic Island, layar ini tetap mendukung tampilan sistem dan notifikasi dengan baik. Selain itu, perangkat ini hanya tersedia dalam dua pilihan warna yaitu hitam dan putih, berbeda dengan varian iPhone 16 lainnya yang hadir dalam lebih banyak pilihan warna.

Dari segi desain, iPhone 16E menggabungkan elemen dari beberapa generasi sebelumnya dengan bodi yang mirip iPhone 15 serta tambahan tombol Action. Perangkat ini juga memiliki ketahanan tinggi dengan sertifikasi IP68 untuk perlindungan terhadap air dan debu serta Ceramic Shield di bagian depan.

Meskipun kembali menggunakan notch, desainnya tetap terlihat modern dan tidak ketinggalan zaman, menawarkan keseimbangan antara fitur klasik dan teknologi terbaru.